7月18至19日，深圳公安消防部門針對省消防總隊林炳榮副總隊長、盧小平總工程師一行督導發現的深圳灣體育中心下沉廣場地下室違章搭建辦公、住宿板房的火災隱患問題，及時向大運總指揮部、開幕式運行團隊、市公安局匯報，深圳公安消防部門迅速行動、連夜查處，積極采取“封、停、拆”等強硬措施，強力推進大運會開幕式場館火災隱患整改。
7月15日，深圳灣體育中心消防安保團隊在巡查中發現，體育中心西側下沉廣場地下室內新增設了11排80間臨時板房(建筑面積約1300平方米)，其中8排68間屬深圳灣體育中心承建總包搭建作為辦公室使用，3排12間作為大運開幕式運營團隊職能用房還未完工，臨時板房使用了可燃材料搭建，隔溫材料為聚氨酯。西側原商鋪設工地施工人員集體宿舍（共11間住有88人），電源電線亂拉亂接。地下室設置臨時倉庫，存放施工建筑材料，并有個別看守人員住宿。針對發現的問題，消防安保團隊立即對華潤深圳灣發展有限公司下發了《火災隱患限期整改通知書》，限期在7月17日前整改完畢。
7月18日,省消防總隊林炳榮副總隊長、盧小平總工程師，防火部羅云慶部長一行檢查深圳灣開幕式場所消防安保工作中發現，西側下沉廣場地下室違章搭建辦公、住宿板房的火災隱患問題仍未整改，當日下午即召集總隊專家督導組、深圳公安消防監督管局、深圳現役消防支隊召開協調會，明確要求必須立即采取強制措施，堅決快速拆除違章建筑。根據總隊領導指示要求，深圳市公安局高度重視，副局長胡曉明同志要求深圳消防監督管理局、南山消防大隊對違章搭建板房立即采取查封措施，嚴格進行調查處理；深圳消防監督管理局劉躍紅副局長率領支隊、南山大隊同志迅速到達現場、查明隱患詳情和責任主體，18日下午即對地下室住人部位實施臨時查封，對臨時板房辦公區實施停電，并停止宿舍和辦公室的使用。當日晚，工作組同志連夜對下沉廣場地下室住人板房進行逐戶清理，并對拒絕拆遷的市建筑公務署工作人員進行工作訊問；同時從消防中隊調派一輛消防車做好現場看護工作，以防拆遷過程中產生冒煙起火情況。截至7月19日上午，建設單位華潤公司已按要求拆除8排68間臨時板房，搬空臨時集體宿舍，地下室臨時倉庫住人也已清空。
7月19日下午，省消防總隊專家督導組吳丹副局長率隊督導檢查深圳灣體育中心下沉廣場地下室火災隱患整改情況，針對市建筑公務署拒絕拆遷的3排12間板房問題，專家組專門進行建筑材料現場調查取樣，證明該3排板房屋頂材料為可燃的聚氨酯材料，必須禁止使用。在隨后的深圳灣體育中心火災隱患整改協調會上，深圳市公安局王國賓副局長、大運安保總指揮部郭經緯主任、南山區委廖澍華常委認真聽取了開幕式場館團隊、北京設計院、市建筑公務屬、華潤公司等設計、施工和使用單位關于下沉廣場地下室搭建辦公、住宿板房部署情況，以及深圳市公安局、消防監督管理局關于該火災隱患的嚴重性和危害性情況介紹，特別是聽取了總隊專家督導組對建筑材料的現場取樣分析和近年來國內幾起因建筑材料導致重特大火災事故的情況介紹后，一致認為大運會各項工作部署應將安全工作放在第一位，要求對深圳灣體育中心下沉廣場地下室違章搭建辦公、住宿板房進行全部拆除。
19日晚，深圳灣體育中心下沉廣場地下室市建筑公務署最后3排12間板房根據下午專題協調會統一部署，已全面清空停止使用，相關人員及辦公場所已全面協調至安全區域。
